土壤腐殖酸清除剂介绍

土壤和湖海沉积物中都含有棕黑色或黑色的腐殖酸，它们对 PCR 等后续反应有极大的抑制作用，所以有效去除土壤中腐殖酸是提取土壤微生物 DNA  的重要环节，但是目前市场上没有专门的产 品，针对这一情况，上海生工这个产品，专门用于对提取 DNA 用的土壤进行预处理，以清除腐殖酸成分。

1. 清除效果好，一次能使腐殖酸的浓度降低 50%左右。

2. 适合于黄色、红色、黑色和棕黑色等各种质地的土壤和河海沉积物。

3. 操作过程简单快速，一次处理只需要 10 分钟。

4. 扩容性好，可小规模操作， 也可以大规模操作。

疑难解答

如何判断提取的 DNA 没有腐殖酸污染？

• 方法一是目测法，即看得到的溶液是否无色。如果呈淡棕黑色或淡黄色，说明可能是少量残留的未除尽的腐殖酸。

• 方法二是检测最大光吸收。

注意：有腐殖酸污染并不表示 DNA 不能使用，有的腐殖酸并不抑制 PCR 扩增。

腐殖酸的最大吸收波长是多少？

• 腐殖酸（humic acid）是一大类呈棕黑色或黑色的物质,其结构千差万别，土壤中腐殖酸的组成和特点随土壤不同而不同， 所以其最大吸收波长也各不相同。有的土壤的腐殖酸的最大吸收波长在 260 nm（见 Appl. Environ. Microbiol., 63：4993, 1997），有的则在 340 nm ，所以用特定的波长测定 OD 值时波长的选定要根据土壤而决定。Sigma, Fluka 等公司出售 的腐殖酸产品成分一般比较简单，其最大吸收波长不能推广到成分更为复杂的土壤腐殖酸样品。

是否腐殖酸都会抑制后续的 DNA 反应？

• 否，因为腐殖酸是一大类物质的统称，他们的结构和特性各不相同，所以是否对后续反应有影响最好通过实验来验证。如果用提取的 DNA 溶液原液进行反应而反应没发生，而对照样品 （已知的不含污染的 DNA）能够发生，说明可能有抑制作用。